Los futuros profesores de las universidades públicas deben contar con la evaluación positiva de su actividad como requisito previo para formalizar su contrato laboral como "profesor ayudante doctor" o "profesor contratado doctor" y el 60% del profesorado doctor de las universidades privadas deben contar también con esta evaluación. La ACAP es la encargada de llevarlas a cabo en la Comunidad de Madrid, de forma que en los últimos cuatro años esta Agencia ha realizado más de 10.000 evaluaciones sobre la calidad de la actividad docente, investigadora y profesional de los profesores universitarios.
El sistema de evaluación del profesorado consta de cuatro criterios de evaluación: experiencia, producción académica y científica y su difusión, formación y otros méritos. Y cada uno de estos criterios se subdivide en subcriterios que contienen a su vez los méritos que sirven de base para la evaluación.