La distribución de los fondos se hace de forma proporcional y se valoran las actividades docentes e investigadoras y el cumplimiento de los objetivos logrados por cada universidad con respecto a la valoración media alcanzada por el sistema universitario público en su conjunto.
En 2009, las seis Universidades Públicas reciben sus correspondientes subvenciones nominativas por importe de 959,4 millones y, además, las universidades Autónoma, Carlos III y Rey Juan Carlos reciben una dotación adicional de 309.081 euros, 108.793 euros y 979.698 euros, respectivamente, en aplicación del régimen transitorio del nuevo modelo de financiación de 2009.
Las cantidades totales que percibirán cada una de las seis universidades durante el ejercicio de 2009 serán las siguientes: Universidad de Alcalá (88,7 millones), Autónoma (141,9), Carlos III (87,6), Complutense (352,5), Politécnica (211,5) y
Este modelo de financiación se basa en la distribución de fondos a través de variables de capacidad, actividad, calidad y objetivos de mejora y se distribuye en tres fondos: uno de financiación básica, destinado a las actividades básicas de docencia e investigación, otro de financiación por objetivos, destinado a consolidar mejoras en las áreas estratégicas y un tercero de financiación de necesidades singulares, para sufragar los gastos que no están recogidos en los casos anteriores.
Fuente: Comunidad de Madrid